《华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南》先从整体上对国内外生物信息数据库进行整体的概述。从数据来源、数据类型、生物数据分析方法、生物信息分析平台等方面探讨如何对生物数据库的数据进行管理，包括数据采集、数据存储、备份和恢复等。然后介绍了数据库设计的方法、原则及常见生物信息数据库的特点并以NCBI为例介绍了数据库如何提交数据、检索数据等。最后探讨了数据库的伦理学及知识产权保护问题。
前言
**篇生物信息数据库概述
1生物信息数据库
1.1生物信息数据库概述
1.2生物信息数据库的分类
2国内外生物信息数据库的发展
2.1国际生物信息数据库的发展
2.2*国的生物信息数据库建设
2.3建设生物信息数据库：存在的问题和解决思路探讨
第二篇用于建立生物信息数据库的数据管理
3数据来源
3.1从各种生物信息数据库的FTP下载
3.2各种生物信息数据库的查询结果
3.3各实验终端提供的数据
4数据类型
4.1原始数据
4.2生物信息分析数据
5生物信息分析平台
5.1生物信息分析平台简介
5.2Galaxv平台
5.3GenePattern生物分析平台
5.4DNAnexus生物分析平台
5.5BlastforneKPProject
6数据质量管理规范
6.1数据质量概述
6.2生物数据的质量控制
7数据存储管理
7.1存储内容
7.2大数据存储
7.3存储方式
7.4存储管理一般原则
8数据备份和恢复管理规范
8.1数据的备份
8.2数据的恢复
9数据安全管理规范
9.1数据分类
9.2权限管理
9.3注意事项
第三篇建立生物信息数据库的实用指南
10概述
10.1引言
10.2数据相关的基本概念
11数据库设计
11.1数据库设计过程
11.2数据库设计规范(以关系数据库为例)
11.3数据库命名规范
12常见生物信息数据库特点
12.1数据模型
12.2数据库的存储
13生物信息数据库系统开发
13.1虚拟本地数据库
13.2本地数据库
第四篇生物信息数据库的使用管理规范
14数据库的安全性管理
14.1安全性的类型
14.2数据库安全性控制方法
14.3基于角色访问控制的安全性和权限管理
15数据提交管理
15.1概述
15.2提交内容
15.3提交方式
16数据共享和交互
17数据检索
17.1检索工具
17.2检索结果格式
第五篇伦理学问题
18国际伦理法则
19生物大数据中的伦理问题
20国内生物信息数据库中的伦理问题
21伦理规范
21.1伦理的原则
21.2关于知情同意
22伦理审查建设
22.1公开透明的政策和社会广泛参与
22.2信息的处理(保密和告知研究结果)应以参与者利益为重
22.3建立有效的监督和责任机制
22.4加强伦理审查能力建设
第六篇生物信息数据库知识产权保护
23引言
24国内外数据库权利保护相关条约、协议
24.1欧盟数据库法律保护
24.2美国数据库法律保护
24.3WIP0数据库法律保护
24.4我国数据库法律保护现状
25生物信息数据库的保护模式探讨
25.1存在的问题
25.2生物信息数据库知识产权保护建议
参考文献
缩略语表
名词术语
暂无
