本教材以生物信息学的理论方法为基础，突出生物信息学在生物医学组学大数据下的实际应用，同时有适当的精准医学知识的拓展。本教材注重理论联系实际，做到体系简洁，结构合理，力求满足应用型人才培养的需求。本教材共分为十五章。第一章绪论，重在陈述大数据时代下的生物信息学内涵，以及生物信息学在精准医学发展中的重要作用。第二章至第四章以生物信息学基础知识与基础资源为主，包含生物医学信息学基础资源、序列比对、高通量测序技术。第五章至第十四章以组学系统为索引，包括基因组、表观组、转录组、调控组、蛋白质组、功能组、通路组、互作组、药物基因组，重点突出不同组学数据的生物信息学分析理论基础、相关数据资源及实践操作方法。
绪论 1
第一节 生物信息学的发展历程 1
第二节 生物信息学的研究方法及应用 3
一、 生物信息学研究方法 3
二、 生物信息学在生命科学中的应用 4
第三节 大数据与大健康时代的生物信息学 5
一、 多组学大数据的产生与生物信息学 5
二、 大数据和精准医学时代的生物信息学 8
三、 面向大健康时代的生物信息学 9
第一篇 生物信息学基础
第一章 生物序列资源 12
第一节 引言 12
第二节 NCBI 数据库与数据资源 13
一、 NCBI 数据库资源概述 13
二、 NCBI 中的重要基础数据库介绍 14
第三节 UCSC 基因组浏览器与数据资源 18
一、 UCSC 概述 18
二、 UCSC 基因组浏览器 19
三、 UCSC 中的数据资源和常用工具 22
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