由杨焕明编著的《基因组学(2016)》是基因组学的综合性入门教科书,阐述了基因组学的起源和发展史、理念和基本概念、研究领域和核心技术,特别是基因组学对生命科学和生物技术的全面贡献;讨论了相关的生命伦理与生物安全问题;从不同角度概括了基因组学这一学科的定义、理念、源流发展趋势及应用范例;介绍了基因组学相关技术在生命科学和生物产业中的地位及其对人类社会的影响。
本书可作为已具备遗传学基础的本科生和基因组学相关专业的研究生教材使用,也可供从事与基因组学相关的生物产业,特别是农业与医学等领域的研究人员参考。
第一部分 基因组学概论
第一篇 《基因组学》导读
第一节 基因组学的一般定义
一、基因组学和基因组
二、基因组学与其他学科的关系及分科
第二节 基因组学的两个理念
一、生命是序列的
二、生命是数字的
第三节 基因组学的三个源流
一、演化学说
二、细胞学说
三、基因学说
第四节 测序技术的四个突破
一、直读
二、自动化
三、规模化
四、MPH
第五节 基因组学发展的五大趋势
一、重绘“生命之树”
二、群体基因组分析
三、个体基因组分析
四、“跨组学”分析
五、基因组的生物学
第六节 基因组学应用的六个方面
一、外显子和全外显子组测序——单基因性状与遗传病
二、全基因组测序——复杂性状与常见疾病
三、单细胞测序——基因组异质性
四、META基因组测序——微生物及病原基因组
五、微(痕)量DNA测序——无创检测、法医和古DNA
六、“数据化”育种与生物条码
第七节 正在改变世界的七项技术
一、合成基因组学
二、基因组编辑技术
三、干细胞与iPS技术
四、动物克隆
五、大数据与生物库
六、表型组分析
七、“组学”与相关技术
第八节 基因组伦理学的八个方面(HELPCESS)
一、人文(H,Humanity)
二、伦理(E,Ethics)
三、法律(L,Law)
四、公众关系和决策(P,Public-relationship/Policy-making)
五、文化(C,Culture)
六、经济和教育(E,Economy/Education)
七、生物安全和防护(S,Safety and Security)
八、社会(S,Society)
第九节 中国对基因组学的九大贡献
一、1%国际人类基因组计划(HGP)
二、10%国际单体型图计划(HapMap计划)
三、国际千人基因组计划(G1K计划)
四、国际癌症基因组计划(ICGP)
五、水稻和家蚕基因组计划
六、META基因组
七、“生命之树”与动植物基因组
八、“第二代酵母”全基因组设计和合成
九、倡导“HGP精神”和“合作”的文化
第二篇 基因组学的发展史
第一节 HGP的起始和学术源流
一、HGP的讨论和启动
二、HGP的国际化
三、HGP的学术源流
第二节 HGP的目标和技术路线
一、HGP的技术目标
(一)遗传图
(二)物理图
(三)转录图
(四)序列图
二、HGP的技术路线
(一)定位克隆霰弹法
(二)全基因组霰弹法
第三节 HGP中的模式生物
一、大肠杆菌
二、酿酒酵母
三、秀丽线虫
四、黑腹果蝇
五、拟南芥
六、河豚鱼
……
第二部分 基因组学的方法学
第一篇 DNA测序
第二篇 序列的组装和分析
第三部分 基因组的生物学
第一篇 人类基因组
第二篇 动物基因组
第三篇 植物基因组
第四篇 微生物基因组
第四部分 基因组的设计和合成
第五部分 基因组伦理学
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